Σε μια μεγάλη μητρόπολη, έχουν σημειωθεί αρκετά ατυχήματα στον αγωγό μέσω του οποίου το νερό εισέρχεται στην πόλη. Εσείς στο παιχνίδι Pipes: The Puzzle θα πρέπει να επισκευάσετε σωλήνες. Μια συγκεκριμένη περιοχή θα είναι ορατή στην οθόνη μπροστά σας. Οι σωλήνες θα είναι υπόγειοι. Με το ποντίκι μπορείτε να περιστρέψετε μερικά από αυτά στο διάστημα. Ο στόχος σας είναι να εκθέσετε τους σωλήνες έτσι ώστε να συνδέονται μεταξύ τους. Μόλις αποκατασταθεί ολόκληρος ο αγωγός, θα περάσει νερό από αυτόν. Μόλις μπει στην πόλη, θα σας δοθούν πόντους στο παιχνίδι Pipes: The Puzzle και θα προχωρήσετε στην επισκευή του επόμενου τμήματος.
