Σε έναν μακρινό καταπληκτικό κόσμο, πλάσματα όπως το Pokemon ζωντανά Χωρίζονται σε ομάδες που λατρεύουν τα πνεύματα της φύσης. Κάποτε, οι λάτρεις των πνευμάτων της φωτιάς και του νερού πραγματοποίησαν ένα τελετουργικό και κάλεσαν αυτές τις θεϊκές οντότητες σε αυτόν τον κόσμο. Αλλά αποδείχθηκαν πολύ κακά πνεύματα και ξεπέρασαν τον έλεγχο. Τώρα ολόκληρος ο πλανήτης βρίσκεται σε χάος και συνεχώς συμβαίνουν φυσικές καταστροφές. Εσείς στο παιχνίδι Pokemon Emerald Version θα πρέπει να τα πολεμήσετε. Μπροστά σας στην οθόνη θα δείτε μια συγκεκριμένη περιοχή στην οποία θα βρίσκονται οι χαρακτήρες σας. Θα επιτεθούν, για παράδειγμα, το πνεύμα της Φωτιάς. Θα κατευθύνετε τις ενέργειές τους χρησιμοποιώντας έναν ειδικό πίνακα ελέγχου. Με τη βοήθεια του, θα αναγκάσετε το Pokémon σας να εφαρμόσει διάφορα μαγικά ξόρκια με τα οποία θα βλάψει τον αντίπαλό του.