Η διαστημική δύναμη προσγείωσης στο Doom 2D στάλθηκε στον Άρη, όπου βρίσκεται ένα συγκρότημα που ανήκει στην United Space Corporation. Εκεί έγινε μυστική έρευνα για την Κόλαση. Το εργαστήριο χτίστηκε σε μια πύλη μόλις ανακαλύφθηκε και οι επιστήμονες άρχισαν να το μελετούν και τη δυνατότητα χρήσης του προς όφελος της ανθρωπότητας. Τελικά, όλα δεν πήγαν όπως τα σχεδίαζαν. Οι δαίμονες βγήκαν από την πύλη και επιτέθηκαν στους αποίκους. Ο αλεξιπτωτιστής πρέπει να ανακτήσει μυστικά ερευνητικά αρχεία σε σκληρούς δίσκους και να σώσει όσους παραμένουν ζωντανοί. Βοηθήστε τον, θα πρέπει να μετακινηθεί στις εγκαταστάσεις, πολεμώντας δαιμονικά πλάσματα στο Doom 2D.
