Ένα πλάσμα με το όνομα Pixelmon ζει στον κόσμο του Minecraft. Κατά κάποιο τρόπο ο ήρωας μας πήγε στις πιο απομακρυσμένες περιοχές της χώρας για να εγκατασταθεί εδώ και να χτίσει μια μικρή πόλη. Εσείς στο παιχνίδι Pixelmon Craft θα τον βοηθήσετε σε αυτό. Μπροστά σας στην οθόνη θα δείτε τον χαρακτήρα σας, ο οποίος βρίσκεται σε μια συγκεκριμένη τοποθεσία. Στο πλάι του, ένας μικρός χάρτης θα είναι ορατός με εικονίδια που υποδεικνύουν τη θέση των διαφόρων πόρων. Ο ήρωάς σας θα πρέπει να επισκεφτεί όλα αυτά τα μέρη και να πάρει αυτούς τους πόρους. Στη συνέχεια, χρησιμοποιώντας έναν ειδικό πίνακα ελέγχου, θα ξεκινήσετε την κατασκευή διαφόρων κτιρίων για τις ανάγκες του ήρωα μας. Μπορείτε επίσης να δημιουργήσετε νέα εργαλεία και όπλα.