Ο Mario, ένας υδραυλικός που αγαπήσαμε όλοι μας, άρχισε να ενδιαφέρεται για ένα τέτοιο σπορ δρόμου όπως το παρκούρ. Ο ήρωάς μας αποφάσισε να εκπαιδευτεί σε αυτό το άθλημα στις στέγες των κτιρίων της πόλης. Εσείς στο Super Mario City Run θα συμμετάσχετε μαζί του σε αυτήν την προπόνηση. Μπροστά σας στην οθόνη θα δείτε τον Μάριο να στέκεται στην ταράτσα του σπιτιού. Υπό την καθοδήγησή σας, θα τρέξει προς τα εμπρός ανεβάζοντας σταδιακά ταχύτητα. Κοιτάξτε προσεκτικά την οθόνη. Στο δρόμο του ήρωά σας θα υπάρξουν αστοχίες που χωρίζουν τις στέγες των κτιρίων. Όταν τρέχει σε ένα από αυτά σε μια συγκεκριμένη απόσταση, θα πρέπει να τον κάνετε να πηδήξει. Έτσι, ο ήρωάς σας θα ξεπεράσει αυτόν τον κίνδυνο. Επίσης, εμπόδια θα εμφανιστούν μπροστά στον Mario. Σε μερικά από αυτά, θα μπορεί να σκαρφαλώσει στο τρέξιμο, κάτω από άλλα, αντίθετα, θα χρειαστεί να οδηγήσει ανάσκελα κάτω από το κάτω μέρος. Στο δρόμο, ο Mario πρέπει να πάρει διάφορα αντικείμενα που θα σας φέρουν πόντους και μπορούν να δώσουν στον ήρωα διάφορα είδη μπόνους.