Ο μυστικός πράκτορας, με την κωδική ονομασία # 46, θα πρέπει να εκτελέσει πολλές αποστολές σε όλο τον κόσμο σήμερα. Εσείς στο παιχνίδι Super Spy Agent 46 θα τον βοηθήσετε σε αυτό. Επιλέγοντας μια αποστολή, θα βρεθείτε σε μια συγκεκριμένη περιοχή. Με τη βοήθεια των πλήκτρων ελέγχου, θα κάνετε τον ήρωά σας να προχωρήσει μπροστά. Κοιτάξτε γύρω σας προσεκτικά. Μόλις παρατηρήσετε τον εχθρό, στοχεύστε το όπλο σας εναντίον του και πιάστε τον στο πεδίο. Όταν είναι έτοιμο, ανοίξτε φωτιά για να σκοτώσετε. Πυροβολώντας με ακρίβεια, θα σκοτώσετε τους εχθρούς. Για αυτό θα σας δοθούν πόντους. Μετά το θάνατο ενός εχθρού, μπορεί να πέσουν τρόπαια από μέσα του. Θα χρειαστεί να συλλέξετε αυτά τα αντικείμενα. Θα βοηθήσουν τον ήρωά σας να επιβιώσει και να κερδίσει περαιτέρω μάχες.
