Ο γενναίος ninja Kim έλαβε ένα καθήκον από το κεφάλι του να διατάξει να διεισδύσει στο φυλασσόμενο κτίριο της πόλης και να κλέψει μυστικά έγγραφα από εκεί. Εσείς στο παιχνίδι Hero Ninja θα βοηθήσετε τον ήρωά σας να ολοκληρώσει αυτό το έργο. Ο χαρακτήρας σας θα μετακινηθεί κατά μήκος των στέγων των κτιρίων της πόλης, κερδίζοντας σταδιακά ταχύτητα. Υπό την ηγεσία σας, ο χαρακτήρας σας θα πρέπει να πηδήξει και να πετάξει μέσα από τα κενά ανάμεσα στα κτίρια. Μόλις συναντήσετε έναν εχθρό, θα πρέπει να κάνετε κλικ στην οθόνη με το ποντίκι για να αναγκάσετε τον ήρωα σας να χτυπήσει με το σπαθί και έτσι να καταστρέψει τους εχθρούς του.