Ο ήρωας του παιχνιδιού Counter-Strike: Reboot, με τη βοήθειά σας, θα λάβει μέρος σε δώδεκα αποστολές. Επειδή το περιεχόμενο διατηρείται αυστηρά μυστικό, οι στόχοι θα αποκαλυφθούν καθώς ολοκληρώνετε την προηγούμενη αποστολή. Το πρώτο ονομάζεται Alpha και το καθήκον σας είναι να αποκρούσετε την επίθεση τρομοκρατών που θέλουν να καταλάβουν τη βάση σας. Σε άλλες αποστολές θα πρέπει να εκτελέσετε άλλες εργασίες, όπως: απελευθέρωση ομήρων, καταστροφή βάσεων τρομοκρατών, εκκαθάριση ναρκών και ούτω καθεξής. Όλες οι αποστολές είναι περιορισμένες χρονικά, πρέπει να λύσετε προβλήματα γρήγορα και αποτελεσματικά στο Counter-Strike: Reboot.
