Ο διάσημος χαρακτήρας κινουμένων σχεδίων, ο σωτήρας της ανθρωπότητας, ο δεκάχρονος Ben Tennyson έχει ένα πλεονέκτημα έναντι των άλλων γήινων στο ότι μπορεί να χρησιμοποιήσει ένα ειδικό ρολόι εξωγήινης προέλευσης, το οποίο μπορεί να τον μετατρέψει σε διάφορους εκπροσώπους άλλων πλανητών. Αλλά στο παιχνίδι Ben 10 Run δεν θα υπάρχουν μεταμορφώσεις, ο ήρωας θα βασιστεί στη δική του δύναμη και αντοχή. Θα πρέπει να τρέξει σε μια ανοιχτή περιοχή της ερήμου, πηδώντας πάνω από διάφορα εμπόδια. Ο λόγος της φυγής του είναι η εξαφάνιση της ξαδέρφης του Γκουέν. Πρέπει να κάνετε τα πάντα γρήγορα χωρίς να χάσετε χρόνο, επομένως πρέπει να βοηθήσετε τον ήρωα να πηδήξει πάνω από εμπόδια και να συλλέξει κρυστάλλους στο Ben 10 Run.