Για πολύπλοκες και υπεύθυνες εργασίες, όταν είναι αδύνατο να δημιουργηθεί περιττός θόρυβος, διορίζονται πράκτορες με ειδικές δεξιότητες και ικανότητες. Τέτοιος στο παιχνίδι Stealth Master 3D είναι ο ήρωάς μας. Προσπαθεί να μην χρησιμοποιεί φορητά όπλα, αλλά τα καταφέρνει με σπαθιά, μαχαίρια, ξίφη για να ενεργεί σιωπηλά, χωρίς να τραβήξει την προσοχή. Πριν από κάθε επίπεδο, θα λάβετε μια εργασία και πρέπει να την ολοκληρώσετε για να αποκτήσετε μια νέα. Ένας πράκτορας αυτού του επιπέδου δεν πρέπει να κάνει λάθος. Μπείτε κρυφά στο δωμάτιο, πλησιάστε έναν εχθρό που δεν γνωρίζει και χτυπήστε. Εάν γυρίσει και ο ήρωάς σας βρίσκεται στην περιοχή της κόκκινης δέσμης, η αποστολή θα αποτύχει στο Stealth Master 3D.
