Ένας πόλεμος ξέσπασε στο βασίλειο της θάλασσας μεταξύ των δύο προσποιητών του θρόνου. Κατά τη διάρκεια των εχθροπραξιών, και οι δύο πλευρές χρησιμοποιούν ειδικά εκπαιδευμένα αποσπάσματα μάχης ψαριών. Στο παιχνίδι BattleFish, θα συμμετάσχετε σε ένα από τα πάρτι και θα διοικήσετε μία από τις ομάδες των ψαριών. Μια συγκεκριμένη τοποθεσία που βρίσκεται κάτω από το νερό θα είναι ορατή στην οθόνη μπροστά σας. Από τη μία πλευρά θα υπάρχουν τα ψάρια μάχης σας, και από την άλλη πλευρά του εχθρού. Στο κάτω μέρος θα υπάρχει ένας ειδικός πίνακας ελέγχου με εικονίδια. Με τη βοήθειά τους, θα κατευθύνετε τις ενέργειες της ομάδας σας. Θα πρέπει να εξετάσετε προσεκτικά τα εχθρικά ψάρια και να επιλέξετε τον στόχο σας για να το επιτεθείτε. Τα ψάρια σας θα χτυπήσουν από κοινού και θα καταστρέψουν τον εχθρό. Για αυτό θα λάβετε πόντους.