Ο Pixel Mario ξεκινά να καθαρίσει το Mushroom Kingdom από την κυριαρχία των τσιράδων του κύριου εχθρού του Bowser στο Mario Combat. Ο υδραυλικός προετοιμάζεται εδώ και πολύ καιρό, μελετώντας διάφορα είδη πολεμικών τεχνών και τώρα ήρθε η ώρα να τα εφαρμόσει. Με τη βοήθειά σας, ο Mario θα κινηθεί πηδώντας σε πλατφόρμες. Όταν συναντάτε έναν άλλο εχθρό, πρέπει να τον καταστρέψετε χρησιμοποιώντας γροθιές ή κλωτσιές. Εξοικονομήστε την ενέργειά σας, γιατί υπάρχει μια συνάντηση μπροστά με τον κύριο εχθρό - τον Bowser, και είναι αρκετά δυνατός. Χρησιμοποιήστε τα πλήκτρα βέλους για να μετακινηθείτε και το πλήκτρο A για να επιτεθείτε στο Mario Combat.
