Υπάρχει μια λατρεία, όπου νεαρά αγόρια μαθαίνουν την τέχνη του ninja. Αυτό είναι ένα πολύ δύσκολο μονοπάτι, το οποίο απαιτεί όχι μόνο μια καλή φυσική προετοιμασία, αλλά και σθένος. Για τη συμμόρφωση με όλους τους νόμους του κώδικα ninja, όχι ο καθένας μπορεί. Το παιχνίδι Ninja Boy, θα πρέπει να εισαχθεί σε Kuhn, ένα αγόρι που αποφάσισε να αφιερώσει τη ζωή του στον κώδικα ninja. Χθες, δέχθηκε επίθεση στο σχολείο του. Οι επιτιθέμενοι δεν είναι άνθρωποι, και μερικά πολύ περίεργα τέρατα. Έκλεψαν όλους τους θησαυρούς του σχολείου ninja. Τώρα, μόνο Kun μπορεί να ανακτήσει τα κλεμμένα, αλλά χρειάζεται τη βοήθειά σας. Θα πρέπει να τον καθοδηγήσει, ώστε να, με τον ελάχιστο αριθμό των κινήσεων, να σκοτώσει τα τέρατα και τους θησαυρούς επέστρεψε.
