Οι γενναίοι νίντζα σήμερα πρέπει να διεισδύσουν στο στρατόπεδο του εχθρού και να καταστρέψουν τον αρχηγό τους. Εσείς στο παιχνίδι Ninja Hands θα τον βοηθήσετε σε αυτή τη μάχη. Μπροστά σας στην οθόνη θα δείτε τον δρόμο στον οποίο θα κινηθεί ο ήρωάς σας. Στο δρόμο του θα υπάρχουν διάφορες παγίδες και εμπόδια που θα πρέπει να ξεπεράσει υπό την ηγεσία σας. Μόλις παρατηρήσετε τον εχθρό, επιλέξτε ένα όπλο χρησιμοποιώντας έναν ειδικό πίνακα στον οποίο θα βρίσκονται τα εικονίδια. Επιλέγοντας, για παράδειγμα, ένα ξίφος, θα συναντηθείτε σε μια μονομαχία με τον εχθρό. Χτυπώντας θα πρέπει να καταστρέψετε τους εχθρούς. Για αυτό, θα σας δοθούν πόντους στο παιχνίδι Ninja Hands και θα μπορείτε να σηκώσετε τρόπαια που έχουν πέσει από τον εχθρό.