Μια μικρή νεράιδα που ονομάζεται Kodama ζει σε ένα μαγικό δάσος. Μια μέρα πήγε για ύπνο και δεν πρόσεξε ότι το σπίτι της απειλείται. Ένας τοίχος που αποτελείται από πολύχρωμες φυσαλίδες πέφτει πάνω του. Τώρα στο παιχνίδι Wake Up Little Kodama θα πρέπει να προστατεύσετε το νεράιδα από την καταστροφή ενώ κοιμάται. Θα έχετε στη διάθεσή σας ένα μαγικό κανόνι στο οποίο θα εμφανίζονται πυρήνες διαφορετικών χρωμάτων. Θα πρέπει να εξετάσετε προσεκτικά τις φυσαλίδες και να βρείτε μεταξύ τους ακριβώς το ίδιο χρώμα με το κέλυφος σας. Τότε θα στοχεύσετε το πυροβόλο σε αυτά και θα πυροβολήσετε έναν πυροβολισμό. Ο πυρήνας που χτυπά το σύμπλεγμα φυσαλίδων θα τους καταστρέψει και θα λάβετε πόντους για αυτό. Ο στόχος σας δεν είναι να αφήσετε φυσαλίδες να αγγίξουν το έδαφος.